63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1645 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  93.41 
 
 		 349 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  702    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  91.98 
 
 		 349 aa  649    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  71.59 
 
 		 353 aa  520  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  50.13 
 
 		 414 aa  342  7e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  21.78 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  25.21 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  25.07 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  24.3 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.25 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  24.8 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  27.5 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  21.64 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  37.19 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.9 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  22.97 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.85 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  20.8 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  28.36 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  24.53 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0554  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  33.8 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  22.64 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  23.62 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  19.43 
 
 		 914 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  21.32 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  19.43 
 
 		 900 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  23.22 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  23.05 
 
 		 410 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.12 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.26 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  22.37 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.78 
 
 		 1078 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  29.9 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  22.55 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  19.03 
 
 		 900 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.47 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  23.33 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  20.23 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.89 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  23.42 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.27 
 
 		 1109 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  23.42 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  23.74 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  23 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.48 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0361  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1109 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175688  normal  0.763709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.33 
 
 		 1109 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.48 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  23 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  23 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  23 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.44 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.19 
 
 		 1082 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>