218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0265 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0265  putative RNA methylase  100 
 
 
375 aa  757    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2415  putative RNA methylase  58.67 
 
 
373 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0460836  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2378  putative RNA methylase  60.33 
 
 
399 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74505  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2577  putative RNA methylase  52.11 
 
 
374 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.274965  hitchhiker  0.00000225035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0018  putative RNA methylase  52.05 
 
 
370 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000217625  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  36.16 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  36.15 
 
 
393 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  35.71 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  36 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  33.33 
 
 
375 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  33.33 
 
 
375 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  35.08 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  35.98 
 
 
391 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  35.9 
 
 
375 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  36.29 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  33.15 
 
 
399 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  34.57 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  31.96 
 
 
374 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.73 
 
 
708 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  34.77 
 
 
389 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.52 
 
 
375 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.77 
 
 
718 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.53 
 
 
713 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  35 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.08 
 
 
749 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  35.02 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  31.71 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  29.77 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.09 
 
 
721 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  30.65 
 
 
374 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  34.14 
 
 
432 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  28.92 
 
 
371 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  31.59 
 
 
417 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  29.97 
 
 
377 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.61 
 
 
712 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1764  putative RNA methylase  32.24 
 
 
411 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
709 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
709 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
709 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.93 
 
 
709 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.06 
 
 
738 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.31 
 
 
707 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.07 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.07 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.94 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.07 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.07 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
709 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.07 
 
 
702 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.54 
 
 
718 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.9 
 
 
706 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  30.59 
 
 
706 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.83 
 
 
713 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
711 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  32.39 
 
 
398 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.65 
 
 
711 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  31.89 
 
 
430 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.83 
 
 
713 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  35.05 
 
 
432 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.94 
 
 
711 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.9 
 
 
706 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.9 
 
 
706 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
713 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 
705 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.83 
 
 
702 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.9 
 
 
705 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  28.9 
 
 
375 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.9 
 
 
706 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.89 
 
 
711 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.55 
 
 
712 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.38 
 
 
708 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.03 
 
 
705 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  30.48 
 
 
374 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.04 
 
 
707 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  32.29 
 
 
433 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  33.73 
 
 
434 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  33.73 
 
 
434 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  33.73 
 
 
434 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  28.98 
 
 
374 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  33.42 
 
 
380 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.99 
 
 
725 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  30.03 
 
 
484 aa  157  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  33.97 
 
 
430 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  30.29 
 
 
388 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  29.43 
 
 
382 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.45 
 
 
707 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  33.6 
 
 
433 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  32.52 
 
 
425 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  31.89 
 
 
374 aa  155  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.45 
 
 
707 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.92 
 
 
752 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>