27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1281 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  29.71 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  33.86 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  33.86 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  31.89 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  34.15 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  32.03 
 
 
214 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  31.5 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  29.29 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  31.31 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  31.37 
 
 
152 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  32.2 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  30.33 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  31.03 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  26.71 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  29.29 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  28.28 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  26.06 
 
 
150 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  40.8  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>