213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1030 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  46.58 
 
 
736 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  67.54 
 
 
774 aa  1110    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  67.94 
 
 
774 aa  1122    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  67.81 
 
 
774 aa  1119    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  68.2 
 
 
774 aa  1112    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  81.76 
 
 
775 aa  1331    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  80.16 
 
 
776 aa  1311    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  46.37 
 
 
737 aa  678    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  68.86 
 
 
774 aa  1126    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  100 
 
 
779 aa  1620    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  68.86 
 
 
770 aa  1101    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  81.41 
 
 
771 aa  1326    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  80.34 
 
 
776 aa  1311    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  66.75 
 
 
774 aa  1096    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  38.15 
 
 
730 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  26.71 
 
 
686 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  27.11 
 
 
768 aa  177  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  26.13 
 
 
752 aa  168  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.63 
 
 
775 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  25.24 
 
 
774 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  25.08 
 
 
758 aa  163  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  25.3 
 
 
747 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  25.89 
 
 
772 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  25.6 
 
 
758 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  26.2 
 
 
600 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  25.15 
 
 
758 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  24.64 
 
 
748 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  24.73 
 
 
743 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  25.39 
 
 
770 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.22 
 
 
657 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.07 
 
 
578 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.29 
 
 
681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.43 
 
 
708 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.31 
 
 
708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.04 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.8 
 
 
564 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.93 
 
 
577 aa  110  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.99 
 
 
580 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.63 
 
 
585 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.04 
 
 
564 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.15 
 
 
562 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  24.17 
 
 
1355 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.56 
 
 
582 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.55 
 
 
601 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  23.35 
 
 
1362 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.05 
 
 
628 aa  98.2  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.91 
 
 
586 aa  98.2  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  23.72 
 
 
1319 aa  97.4  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.33 
 
 
646 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.99 
 
 
632 aa  94  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.53 
 
 
1212 aa  93.2  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.87 
 
 
579 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.26 
 
 
577 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.58 
 
 
645 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.66 
 
 
1258 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.26 
 
 
1220 aa  91.3  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  24.48 
 
 
640 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.26 
 
 
1213 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.73 
 
 
531 aa  88.6  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.66 
 
 
515 aa  88.2  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.51 
 
 
583 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.28 
 
 
514 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.8 
 
 
634 aa  87  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.12 
 
 
629 aa  86.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.7 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.88 
 
 
1210 aa  85.5  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  21.99 
 
 
565 aa  85.1  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.29 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.66 
 
 
513 aa  84.3  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.39 
 
 
1211 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.43 
 
 
645 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  22.64 
 
 
563 aa  83.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.03 
 
 
1217 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  22.22 
 
 
1322 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.64 
 
 
568 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  22.06 
 
 
1209 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.55 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.15 
 
 
1242 aa  81.6  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.14 
 
 
1229 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.67 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.29 
 
 
1230 aa  81.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.95 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.95 
 
 
527 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  21.03 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.53 
 
 
1218 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.14 
 
 
529 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.54 
 
 
519 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.99 
 
 
548 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.45 
 
 
1190 aa  78.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.4 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.09 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.29 
 
 
561 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  20.78 
 
 
1293 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.33 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  22.88 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  20.59 
 
 
515 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.64 
 
 
1229 aa  77  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.6 
 
 
568 aa  77.4  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.8 
 
 
616 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.28 
 
 
1206 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>