More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1624 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1624  ech hydrogenase subunit A  100 
 
 
663 aa  1311    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0024  NADH dehydrogenase (quinone)  50.77 
 
 
635 aa  521  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0364  NADH dehydrogenase (quinone)  50.16 
 
 
636 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.478363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2724  NADH dehydrogenase (quinone)  47.97 
 
 
619 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481092  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1741  NADH dehydrogenase (quinone)  48.4 
 
 
624 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.449294  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1730  NADH dehydrogenase (quinone)  46.82 
 
 
637 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3024  ech hydrogenase subunit A  43.91 
 
 
636 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000133717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  48.25 
 
 
939 aa  466  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1570  NADH dehydrogenase (quinone)  45.44 
 
 
639 aa  468  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.161929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2653  NADH dehydrogenase (quinone)  46.99 
 
 
632 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07220  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  46.63 
 
 
643 aa  444  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000172038  normal  0.975039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2501  NADH dehydrogenase (quinone)  44.37 
 
 
648 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3371  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.35 
 
 
661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4114  NADH dehydrogenase (quinone)  43.23 
 
 
647 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.589277  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1518  NADH dehydrogenase (quinone)  42.46 
 
 
648 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1673  NADH dehydrogenase (quinone)  42.96 
 
 
651 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1082  NADH dehydrogenase (quinone)  42.34 
 
 
624 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.047689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0778  ech hydrogenase subunit A  45.4 
 
 
648 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_763  hydrogenase, EchA subunit  45.05 
 
 
648 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.675229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0860  hydrogenase, EchA subunit, putative  44.07 
 
 
648 aa  365  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0152  ech hydrogenase subunit A  38.72 
 
 
639 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0549  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.06 
 
 
651 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000157723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1098  NADH dehydrogenase (quinone)  42.69 
 
 
653 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.132295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  37.18 
 
 
792 aa  194  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.22 
 
 
769 aa  193  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.94 
 
 
768 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  38.19 
 
 
793 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.85 
 
 
827 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.94 
 
 
770 aa  191  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.58 
 
 
768 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.63 
 
 
967 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.64 
 
 
969 aa  188  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.28 
 
 
953 aa  187  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.32 
 
 
971 aa  187  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.57 
 
 
970 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.05 
 
 
782 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.89 
 
 
959 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.13 
 
 
801 aa  183  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.28 
 
 
972 aa  183  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.66 
 
 
964 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.66 
 
 
964 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.94 
 
 
801 aa  180  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.94 
 
 
801 aa  180  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.76 
 
 
997 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.26 
 
 
790 aa  178  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0350  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.19 
 
 
982 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.08 
 
 
772 aa  177  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.34 
 
 
1004 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  37.24 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  37.13 
 
 
1003 aa  176  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.36 
 
 
792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.99 
 
 
765 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.89 
 
 
799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.5 
 
 
973 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.09 
 
 
654 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.51 
 
 
911 aa  174  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.49 
 
 
968 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.8 
 
 
962 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  33.88 
 
 
980 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.28 
 
 
628 aa  173  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.54 
 
 
764 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.44 
 
 
766 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.28 
 
 
961 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  35.39 
 
 
644 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.64 
 
 
969 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.28 
 
 
785 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1434  NADH dehydrogenase subunit L  34.47 
 
 
600 aa  172  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
958 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.52 
 
 
953 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18970  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.75 
 
 
1032 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.5 
 
 
800 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
948 aa  172  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  32.51 
 
 
661 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.5 
 
 
800 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  32.51 
 
 
661 aa  171  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.59 
 
 
932 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.13 
 
 
767 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  31.63 
 
 
612 aa  171  6e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  32.85 
 
 
620 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  32.3 
 
 
664 aa  170  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  30.72 
 
 
664 aa  170  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.78 
 
 
654 aa  170  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  31.46 
 
 
610 aa  170  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 
1024 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1289  F420H2 dehydrogenase subunit L  36.2 
 
 
665 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.89 
 
 
930 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.67 
 
 
656 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.96 
 
 
1014 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.78 
 
 
642 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.28 
 
 
956 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4894  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.87 
 
 
986 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155841  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.51 
 
 
981 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.9 
 
 
966 aa  168  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.31 
 
 
800 aa  167  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.17 
 
 
786 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.67 
 
 
767 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  35.88 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.4 
 
 
969 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 
781 aa  167  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>