More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5656 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5277  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  98.85 
 
 
786 aa  1542    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5656  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
786 aa  1561    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2333  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.73 
 
 
779 aa  956    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.571725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4314  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.82 
 
 
790 aa  930    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.430687  normal  0.62355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5366  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  98.85 
 
 
786 aa  1542    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11894  hypothetical protein  39.62 
 
 
802 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.291529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1581  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.3 
 
 
814 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.52 
 
 
814 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.889584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3893  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.05 
 
 
820 aa  214  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.454533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.91 
 
 
811 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.91 
 
 
811 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.67 
 
 
811 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199117  normal  0.974632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4229  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.6 
 
 
836 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4970  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.57 
 
 
823 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.883575  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2423  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.91 
 
 
805 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3718  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.51 
 
 
402 aa  177  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  28.29 
 
 
399 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  32.92 
 
 
418 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.91 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.68 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1613  Formyl-CoA transferase  32.68 
 
 
399 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1589  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.68 
 
 
399 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0540324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1559  Formyl-CoA transferase  32.44 
 
 
399 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  31.09 
 
 
404 aa  167  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.28 
 
 
413 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1077  CAIB/BAIF family protein  30.35 
 
 
420 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.674108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4269  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.85 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  29.32 
 
 
396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2861  Formyl-CoA transferase  31.81 
 
 
410 aa  163  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.744926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4496  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.19 
 
 
441 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1522  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.77 
 
 
409 aa  163  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  29.53 
 
 
402 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  29.78 
 
 
402 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.39 
 
 
393 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.74 
 
 
419 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  30.51 
 
 
435 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.79 
 
 
395 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.55 
 
 
398 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.51 
 
 
407 aa  157  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0954  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.78 
 
 
421 aa  157  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0829746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3446  Formyl-CoA transferase  34.76 
 
 
415 aa  157  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  31.6 
 
 
398 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1449  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.54 
 
 
401 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2368  putative L-carnitine dehydratase/bile acid- inducible protein F  31.45 
 
 
435 aa  157  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.19 
 
 
396 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1473  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.25 
 
 
411 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1691  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.69 
 
 
396 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4465  Formyl-CoA transferase  30.9 
 
 
400 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5552  putative formyl-coenzyme A transferase  31.53 
 
 
429 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1212  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.69 
 
 
396 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6977  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.26 
 
 
397 aa  155  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1599  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.19 
 
 
396 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  31.17 
 
 
401 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.63 
 
 
407 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1663  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.69 
 
 
396 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.98 
 
 
395 aa  154  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2624  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.37 
 
 
399 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5189  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.77 
 
 
406 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0395978  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5909  L-carnitine dehydratase  31.28 
 
 
383 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.33 
 
 
401 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.93 
 
 
413 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4504  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.58 
 
 
412 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5106  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.78 
 
 
407 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.912284  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1555  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.35 
 
 
396 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1614  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.4 
 
 
406 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.8 
 
 
410 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2359  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.73 
 
 
406 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.433272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3113  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.32 
 
 
399 aa  153  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1895  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.9 
 
 
400 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3874  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.85 
 
 
416 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.57 
 
 
416 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5067  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.08 
 
 
406 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000803065  hitchhiker  0.00823437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0062  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.4 
 
 
402 aa  152  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1310  Alpha-methylacyl-CoA racemase  30.1 
 
 
406 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2872  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.73 
 
 
406 aa  152  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6415  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.28 
 
 
394 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.835321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1829  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.32 
 
 
413 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2948  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.27 
 
 
416 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.28 
 
 
407 aa  151  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1288  hypothetical protein  29.27 
 
 
409 aa  151  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7130  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.71 
 
 
434 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2202  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0049  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1848  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00504727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1358  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2240  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422635  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.77 
 
 
406 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.31 
 
 
409 aa  151  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.08 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2370  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.907744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1848  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.83 
 
 
401 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1120  CAIB/BAIF family protein  30.91 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.08 
 
 
401 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2825  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.1 
 
 
406 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0265401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  29.4 
 
 
406 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4852  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.2 
 
 
396 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3535  putative L-carnitine dehydratase  29.41 
 
 
427 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1554  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.2 
 
 
413 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  31.59 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0174  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  30.02 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>