47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4705 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
509 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
509 aa  1019    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  71.2 
 
 
509 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  98.62 
 
 
509 aa  1007    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  98.62 
 
 
509 aa  1007    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.34 
 
 
797 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
510 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.58 
 
 
517 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  35.56 
 
 
506 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 
492 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 
492 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  33.27 
 
 
492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  32.88 
 
 
491 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
491 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  32.42 
 
 
486 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 
477 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  32.18 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  31.33 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.21 
 
 
504 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  30.95 
 
 
503 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 
515 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.08 
 
 
503 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.75 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 
398 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  27.03 
 
 
389 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  29.66 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  25.68 
 
 
387 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  25.26 
 
 
379 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  23.41 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  26.12 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  25.24 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  23.67 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  28.75 
 
 
389 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  36.21 
 
 
412 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  22.52 
 
 
394 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  28.17 
 
 
443 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  22.76 
 
 
388 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 
396 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  25.23 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  25.39 
 
 
395 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  28.66 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>