54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2532 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2532  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  360  8e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  23.46 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  24.84 
 
 		 907 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.67 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  26.17 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  23.13 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  26.53 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.34 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  22.45 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  26.8 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  24.03 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  23.13 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  21.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  21.88 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  22.22 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  22.82 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  25.5 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  24.78 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  22.36 
 
 		 466 aa  43.9  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  24.07 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  24.49 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  26.5 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  25.66 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  26.36 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  24.34 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  26.67 
 
 		 518 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  26.32 
 
 		 520 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  25.81 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  25.53 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  25.64 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.53 
 
 		 148 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  26.67 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  24.78 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  26.67 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.06 
 
 		 126 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  27.78 
 
 		 168 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  26 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  26.62 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  24.59 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  23.58 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  24.59 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  22.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  22.95 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  23.33 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  22.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  25.34 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  25.62 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  25.62 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  23.58 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>