28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1857 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.68 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  44.44 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  42.5 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.21 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.02 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  38.75 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.18 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  37.78 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  35.62 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.43 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.52 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.25 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.09 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.95 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  33.77 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.17 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 104 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>