287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3907 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  79.08 
 
 		 239 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  63.48 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  67.23 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  67.23 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  67.23 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  60.67 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  61.14 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  58.92 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  58.72 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  59.49 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  47.73 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  46.19 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  43.57 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  38.24 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  40.09 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  41.14 
 
 		 851 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 851 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  43.84 
 
 		 852 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 846 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 852 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 830 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 848 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 841 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.15 
 
 		 836 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  43.15 
 
 		 834 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.15 
 
 		 858 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 842 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.15 
 
 		 844 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  43.15 
 
 		 830 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.15 
 
 		 839 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  43.15 
 
 		 855 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.15 
 
 		 854 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.15 
 
 		 844 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  43.15 
 
 		 834 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.15 
 
 		 834 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  43.15 
 
 		 835 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  42.66 
 
 		 834 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  42.47 
 
 		 847 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  42.47 
 
 		 847 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  42.47 
 
 		 847 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  42.47 
 
 		 847 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  42.47 
 
 		 848 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  42.47 
 
 		 847 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 836 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 843 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  42.47 
 
 		 830 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  41.78 
 
 		 858 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 840 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  42.66 
 
 		 850 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  42.66 
 
 		 837 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  41.22 
 
 		 829 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 868 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.84 
 
 		 851 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 879 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  41.1 
 
 		 861 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.73 
 
 		 866 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  41.91 
 
 		 862 aa  95.1  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  37.14 
 
 		 818 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  42.5 
 
 		 869 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 828 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  36.81 
 
 		 814 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  39.53 
 
 		 824 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  41.5 
 
 		 812 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  39.53 
 
 		 825 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1711 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 824 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 855 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  39.53 
 
 		 823 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  39.53 
 
 		 843 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  39.53 
 
 		 846 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  39.53 
 
 		 825 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  39.53 
 
 		 822 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  39.53 
 
 		 855 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  39.53 
 
 		 822 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  39.53 
 
 		 821 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  40.31 
 
 		 843 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  37.14 
 
 		 810 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  39.53 
 
 		 859 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 842 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  36.43 
 
 		 811 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  35.66 
 
 		 825 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  36.43 
 
 		 811 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  39.53 
 
 		 842 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  35.71 
 
 		 811 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  38.76 
 
 		 859 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  39.53 
 
 		 841 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  33.56 
 
 		 816 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  37.24 
 
 		 820 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  36.73 
 
 		 812 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  37.39 
 
 		 818 aa  81.6  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>