32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1340 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  100 
 
 		 370 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  71.39 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  55.67 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  55.67 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  55.67 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  50.9 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  40.16 
 
 		 439 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  36.34 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  34.75 
 
 		 514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  35 
 
 		 422 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.52 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.29 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  30.05 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  32.69 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  29.29 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.83 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  30.41 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  27.85 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  30.03 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.93 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  29.25 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  30.03 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  26.38 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  30.1 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  30.35 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  28.8 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  27.81 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0622  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  26.57 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  26.09 
 
 		 285 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0071  hypothetical protein  28.82 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>