40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1217 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  100 
 
 		 73 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  73.21 
 
 		 57 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  73.21 
 
 		 57 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  73.21 
 
 		 57 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  68.42 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  56.25 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  53.57 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  50.88 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  62.96 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.37 
 
 		 57 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  50.88 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  55.36 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  53.57 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  50.88 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  44.64 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  50 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  45.61 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  49.15 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  50.91 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  45.28 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  48.08 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  38.6 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  42.11 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  46.55 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  43.86 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  39.62 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  45.45 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  42.86 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  44.64 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  37.29 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  45.31 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  40.35 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>