221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4070 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  99.36 
 
 		 157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  98.73 
 
 		 157 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  79.49 
 
 		 157 aa  254  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  73.08 
 
 		 157 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  72.44 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  62.82 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  64.97 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  61.69 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  61.04 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  59.74 
 
 		 155 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  58.44 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  53.55 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  52.53 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  56.21 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  56.58 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  48.08 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  48.08 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  52.6 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  44.81 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  45.86 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 152 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  44.23 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  52.29 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  47.13 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  43.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  51.3 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.22 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  47.44 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  39.35 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  52.26 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  40.13 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  42.04 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  49.68 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  42.04 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  41.29 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  42.04 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  42.04 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  42.04 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  42.04 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  42.04 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  42.04 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  39.35 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  39.24 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  50 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  41.51 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>