239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3848 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  98.72 
 
 		 391 aa  753    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 391 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  81.21 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  59.54 
 
 		 382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.23 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.14 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  43.2 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  44.34 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.64 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.06 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.29 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  33.79 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.3 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  29.5 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  29.96 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  31.62 
 
 		 347 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  34.52 
 
 		 388 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  32.19 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  32.86 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  29.64 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  29.37 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  30.39 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  29.22 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.48 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  28.15 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  29.29 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.61 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.7 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.48 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.87 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.87 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.87 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11010  acyl-CoA dehydrogenase  27.91 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.67 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.88 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.65 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1866  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  21.43 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.73 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1952  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.27 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.71 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  26.97 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.97 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  28.89 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.01 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  27.93 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2352  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2310  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.16 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  26.85 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  35.11 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1168  putative acyl-coa dehydrogenase  21.8 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.81 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  24.68 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.97 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1361  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.76 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  22.67 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.73 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.04 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4695  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.24 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.77 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.54 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.64 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  26.52 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.89 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4265  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.12 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2538  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.42 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.844573  decreased coverage  0.00557828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3255  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.33 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.85 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.5 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.71 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  25.82 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.45 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.38 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.42 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.35 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  25.82 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.52 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.67 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.76 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.12 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  26.86 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  23.51 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  25.65 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0949  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.22 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0416018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.62 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6601  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.55 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.275726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.71 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  23.15 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  24.93 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  27.96 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  24.26 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.63 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.56 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.56 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>