47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3676 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3676  integrase, catalytic region  100 
 
 		 38 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  81.08 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  75.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  75.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  75.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  75.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  75.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  72.41 
 
 		 283 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  57.14 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  57.14 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  57.14 
 
 		 271 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  74.07 
 
 		 276 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  57.14 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  57.14 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  55.88 
 
 		 309 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  54.29 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  54.29 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  54.29 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  54.29 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  54.29 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  48.65 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  48.65 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  48.65 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  48.65 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  70.83 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  70.37 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  70.37 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  63.33 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  70.83 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  68 
 
 		 274 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 251 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  54.84 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  54.84 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  54.84 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  57.69 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  57.69 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  59.26 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>