67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3302 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 301 aa  597  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  95.35 
 
 		 309 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  89.76 
 
 		 301 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  55.67 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  38.59 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  40.83 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  34 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  34.14 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  34.14 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  34.25 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  31.15 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.13 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  33.49 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  22.85 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  27.06 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.16 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  26.51 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  26.85 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  26.26 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  26.26 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  27.13 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  27.12 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  26.17 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  27.73 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  29.64 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  29.64 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.37 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  29.3 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  29.64 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  28.3 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  28.39 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  27.19 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  27.19 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  27.31 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  26.47 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  26.47 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  26.89 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  26.89 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  43.86 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  43.86 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.89 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  26.89 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  23.48 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 455 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  23.32 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>