58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1482 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  96.69 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  88.51 
 
 		 148 aa  266  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  63.38 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  32.39 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  35.61 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  32.35 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  34.56 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  28.7 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  41.18 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  28.68 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.83 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  29.7 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  35.38 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  31.76 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 166 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  32.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  44.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  44.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 		 141 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>