89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4606 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
124 aa  252  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.96 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.04 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.62 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  36.27 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.7 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  32.18 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.04 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.83 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.97 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.97 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.19 
 
 
119 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.93 
 
 
123 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.93 
 
 
123 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.9 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.07 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  28.04 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.91 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  31.65 
 
 
237 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.1 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32.22 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  27.1 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.04 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  24.37 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.1 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.65 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.71 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  30.36 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  29.21 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.87 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.17 
 
 
121 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.96 
 
 
119 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  31.96 
 
 
119 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.83 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.41 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  29.67 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.09 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.21 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  34.41 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  34.41 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.18 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  34.41 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  34.41 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  27.35 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  34.41 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.87 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  26.5 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  35.96 
 
 
609 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.87 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.21 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  26.96 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.79 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  26.32 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.03 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.7 
 
 
114 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  27.78 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  30.97 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  29.46 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.7 
 
 
114 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.97 
 
 
113 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.88 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.97 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.27 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.82 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  28.68 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.04 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  26.88 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.63 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  27.88 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  26.92 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.82 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.22 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  25.81 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.7 
 
 
114 aa  40  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32 
 
 
296 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>