42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0525 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  45.93 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  43.93 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  52.71 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  43.35 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  51.08 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  53.15 
 
 		 131 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  51.26 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  41.28 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  41.28 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  34.07 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  40.65 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  44.76 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  63.46 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  38.3 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  36.29 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  38.18 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  38.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  58.33 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  38.98 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  33.63 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  35.09 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  48.28 
 
 		 265 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  48.28 
 
 		 263 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  49.15 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  46.55 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  48.28 
 
 		 249 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  48.28 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  48.28 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  47.46 
 
 		 253 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  50.88 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  41.07 
 
 		 211 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>