29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3268 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  38.35 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  36.57 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  36.57 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  30.17 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.5 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  38.95 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  30.25 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.99 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.99 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  28.35 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  29.75 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.93 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  27.64 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  26.24 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  25.53 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  24.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  25.62 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  27.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  26.27 
 
 		 135 aa  40  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>