42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0199 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  23.05 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  29.63 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  28.84 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.35 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  22.76 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.08 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25.09 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  30.99 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  22.9 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  26.78 
 
 
334 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  26.07 
 
 
574 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  25.09 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  27.22 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  31.19 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  32.31 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  23.34 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4197  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.85 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.97 
 
 
304 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  24.03 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
606 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  29.46 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.52 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  24.33 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
586 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  27.68 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.71 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  24.81 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  25.61 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  24.33 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.82 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2187  hypothetical protein  22.14 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  25.26 
 
 
329 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.1 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  26.9 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.85 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
613 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0657  hypothetical protein  24.12 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  19.34 
 
 
385 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  28.46 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>