30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5315 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  100 
 
 		 353 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  89.49 
 
 		 353 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  97.45 
 
 		 353 aa  698    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  66.85 
 
 		 355 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  66.76 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  52.54 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  51.98 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  53.04 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  46.67 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  44.13 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  39.01 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  42.78 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  43.21 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  41.85 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  33.98 
 
 		 594 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  34.19 
 
 		 590 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  30.14 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  32.39 
 
 		 575 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  31.68 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.9 
 
 		 533 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  27.53 
 
 		 311 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.21 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.67 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  22.97 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  23.4 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  25.81 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  19.6 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1096  hypothetical protein  25.08 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  23.1 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>