31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3932 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3640  hypothetical protein  97.41 
 
 		 348 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0445964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3310  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.65 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2550  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.25 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  27.97 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  24.16 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 435 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 372 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  23.67 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  31.93 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  26.47 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  23.28 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  24.83 
 
 		 285 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  27.19 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.7 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>