68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3625 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 309 aa  613  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  95.35 
 
 		 301 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  90.1 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  56.61 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  38.93 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  39.93 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  33.55 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  32.68 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  34.02 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  34.02 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  29.93 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  34.25 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  23.18 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  25.88 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  28.1 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.16 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  27.21 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  27.48 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  27.69 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  26.32 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  26.32 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  29.85 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  29.44 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  29.64 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  30.32 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  30.32 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  30.32 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  30 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  29.62 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.85 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  28.49 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  28.49 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  42.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  43.86 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  43.86 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  40.35 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  40.35 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  40.35 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  40.35 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  23.35 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 705 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>