More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3094 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  94.68 
 
 
432 aa  772    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
432 aa  850    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.09 
 
 
432 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.31 
 
 
432 aa  842    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.69 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  75 
 
 
431 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.89 
 
 
431 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.75 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.83 
 
 
430 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.2 
 
 
427 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.22 
 
 
424 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.47 
 
 
427 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.41 
 
 
427 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 
428 aa  519  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.7 
 
 
457 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.39 
 
 
421 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.56 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.52 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.42 
 
 
430 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.61 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.98 
 
 
429 aa  504  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.27 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.14 
 
 
427 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.01 
 
 
427 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 
430 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.56 
 
 
433 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.86 
 
 
425 aa  464  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.75 
 
 
412 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.75 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.16 
 
 
426 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 
422 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.52 
 
 
420 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.07 
 
 
434 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.41 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.41 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.92 
 
 
424 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.06 
 
 
421 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.81 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
415 aa  404  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.61 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 
421 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.72 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.72 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
423 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 
418 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
458 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 
420 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
458 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
458 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.01 
 
 
435 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.01 
 
 
423 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 
420 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.01 
 
 
435 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 
423 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.44 
 
 
430 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.05 
 
 
427 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
434 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 
418 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 
423 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
419 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 
414 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
423 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 
418 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 
418 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
423 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
426 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
421 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
426 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
423 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
419 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.31 
 
 
418 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
418 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
421 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
423 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
418 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.81 
 
 
435 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
426 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.74 
 
 
429 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
423 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.45 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
418 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
418 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
426 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.82 
 
 
426 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.23 
 
 
418 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.51 
 
 
429 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 
425 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
437 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 
418 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
432 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.91 
 
 
421 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>