29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3088 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  98.41 
 
 		 273 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  80.08 
 
 		 244 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  51.44 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  47.72 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  43.65 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  35.42 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  32.87 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  34.04 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  33.55 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  31.42 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  29.25 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  30.45 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  28.08 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  29.55 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  37.69 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  45.24 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  19.21 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  30.43 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  37.04 
 
 		 547 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  44.44 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  45.71 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  34.88 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  33.8 
 
 		 383 aa  45.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  35.14 
 
 		 547 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  45.71 
 
 		 1124 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  36.11 
 
 		 256 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>