104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3078 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  98.55 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  90.51 
 
 		 275 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  83.06 
 
 		 281 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  67.29 
 
 		 275 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  65.93 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  64.73 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  63.5 
 
 		 275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  63.24 
 
 		 282 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  67.28 
 
 		 271 aa  345  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  62.73 
 
 		 282 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  65.31 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  62.96 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  61.65 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  61.85 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  63.4 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  60.36 
 
 		 286 aa  323  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  64.52 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  54.71 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  51.84 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  52.59 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  52.03 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  50.19 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.27 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  50.97 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  46.32 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  50.18 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  49.39 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  46.35 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  48.85 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  47.58 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.98 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  48.19 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  45.88 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  45.36 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  51.34 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  49.62 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.43 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.69 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  48.3 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  48.3 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  48.3 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  46.97 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  48.06 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  48.11 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  47.55 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  46.97 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  46.97 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  46.97 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.56 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  45.94 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  46.84 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  42.7 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  49.58 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.8 
 
 		 271 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.86 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  47.56 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  49.16 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  45.11 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  42.96 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  47.08 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.93 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  44.53 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  41.96 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  45.77 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  42 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  47.41 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  40.3 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  45.8 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  43.08 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  42.55 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  42.24 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  38.99 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  41.77 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  39.5 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  35.58 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  40.22 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  38.8 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  39.61 
 
 		 636 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  40.64 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  40.38 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  38.21 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  37.8 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  38.21 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  40.24 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  37.7 
 
 		 334 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  36.07 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.68 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.84 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.58 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1482  tungstate ABC transporter permease  32.12 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0301515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>