291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2683 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  98.97 
 
 
390 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  89.81 
 
 
412 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
412 aa  825    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 
406 aa  339  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 
413 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 
443 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  39.42 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  44 
 
 
407 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 
407 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  42.37 
 
 
411 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
402 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  37.59 
 
 
407 aa  272  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
409 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
408 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  37.14 
 
 
415 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  43.95 
 
 
413 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
406 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 
420 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  37.83 
 
 
410 aa  245  9e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  37.38 
 
 
412 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  32.65 
 
 
407 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
402 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
405 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
406 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
518 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  32.71 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
425 aa  200  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  35.83 
 
 
369 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
417 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  34.58 
 
 
437 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  29.31 
 
 
401 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.03 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  24.49 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
188 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
188 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.31 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.14 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.7 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
748 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.78 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.6 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.91 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
770 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.19 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  27.93 
 
 
401 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  20.68 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.57 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
370 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
376 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  29.49 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.58 
 
 
404 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.43 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.11 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.46 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>