More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1096 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  53.73 
 
 
803 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  58.09 
 
 
720 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  53.07 
 
 
814 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  53.02 
 
 
764 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  55.91 
 
 
759 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  56.47 
 
 
904 aa  747    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  55.29 
 
 
844 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  53.19 
 
 
756 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
731 aa  1410    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  54.95 
 
 
709 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  51.13 
 
 
757 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  59.47 
 
 
712 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  55.86 
 
 
740 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  52.58 
 
 
704 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  57.08 
 
 
718 aa  707    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  56.71 
 
 
716 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  55.36 
 
 
726 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  55.54 
 
 
734 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  59.19 
 
 
711 aa  758    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  53.42 
 
 
738 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  58.2 
 
 
793 aa  757    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  57.48 
 
 
722 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  53.78 
 
 
955 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  50.62 
 
 
734 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  59.32 
 
 
634 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
744 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  55.54 
 
 
712 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 
759 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  52.65 
 
 
758 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  58.74 
 
 
678 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  91.93 
 
 
731 aa  1222    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  55.73 
 
 
758 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  56.22 
 
 
732 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  55.59 
 
 
740 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  55.74 
 
 
713 aa  692    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  48.73 
 
 
768 aa  621  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.93 
 
 
773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.25 
 
 
689 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  52.36 
 
 
777 aa  598  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.68 
 
 
771 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.63 
 
 
784 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.5 
 
 
803 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.64 
 
 
768 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.85 
 
 
787 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  47.46 
 
 
732 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.46 
 
 
732 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  47.46 
 
 
732 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.46 
 
 
732 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  47.33 
 
 
732 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.33 
 
 
732 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.07 
 
 
728 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.33 
 
 
732 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.91 
 
 
732 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.19 
 
 
732 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.61 
 
 
782 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.33 
 
 
782 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.09 
 
 
788 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.19 
 
 
732 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.19 
 
 
732 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.19 
 
 
732 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.19 
 
 
732 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.19 
 
 
732 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
712 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.55 
 
 
712 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 
712 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.16 
 
 
713 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.71 
 
 
709 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
707 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  41.84 
 
 
750 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
712 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
750 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  41.22 
 
 
750 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
767 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
799 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  42.2 
 
 
734 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
801 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
737 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
791 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.86 
 
 
783 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
800 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 
750 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
800 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 
734 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
726 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 
800 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 
800 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
752 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
984 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
701 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
800 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
984 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
748 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
812 aa  458  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  40 
 
 
769 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.19 
 
 
799 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
830 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  41.31 
 
 
812 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  40.8 
 
 
794 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  38.47 
 
 
868 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>