162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0656 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  871    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  70.94 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  65.62 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  66.83 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 542 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 534 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  51.98 
 
 		 570 aa  262  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 358 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 358 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  24.02 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  23.52 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.78 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  23.89 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.61 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  21.73 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 328 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2556  Tryptophan--tRNA ligase  28.57 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  33.03 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>