More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0316 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  100 
 
 		 193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  53.89 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  52.33 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  51.81 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  45.21 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  45.36 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  47.34 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  44.15 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  43.68 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  33.68 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  34.36 
 
 		 233 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  34.72 
 
 		 258 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  34.72 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.53 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  35.42 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33.51 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  33.16 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.04 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  34.38 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  33.16 
 
 		 235 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  33.85 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  32.12 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  32.83 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  30.24 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  33.85 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  29.95 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  33.85 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  33.85 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  33.85 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  33.85 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  30.96 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  31.98 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  31.79 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  32.47 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  32.63 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  32.81 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  30.61 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  32.29 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  32.47 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  29.44 
 
 		 211 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  34.2 
 
 		 267 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  33.68 
 
 		 356 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  34.2 
 
 		 267 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  32.31 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  31.77 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  32.64 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  35.26 
 
 		 211 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  31.25 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  31.44 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  31.25 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  31.61 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  28.12 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  32.09 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  33.7 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  31.98 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  32.81 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  30.48 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  32.81 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  32.81 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  29.95 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  30.41 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  30.73 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  28.71 
 
 		 244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  31.96 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  29.47 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  29.84 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  29.79 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  29.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  31.41 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  29.79 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  32.29 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  29.5 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  32.12 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  30.37 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  30.96 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  30.89 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  31 
 
 		 272 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  29.9 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  31.41 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  31.77 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  29.17 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>