26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0279 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  738    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  49.54 
 
 
386 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  45.27 
 
 
361 aa  292  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  43.28 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  38.46 
 
 
297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.39 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  36.51 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  35.45 
 
 
421 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  35.8 
 
 
423 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  39.31 
 
 
414 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  34.16 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  30.65 
 
 
606 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  31.47 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  35.96 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  27.11 
 
 
164 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  27.68 
 
 
165 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  26.86 
 
 
162 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  27.84 
 
 
165 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  28.66 
 
 
239 aa  49.7  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  26.7 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0078  DNA polymerase I-like  31.71 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  26.88 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2984  hypothetical protein  25.53 
 
 
562 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  26.95 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 
237 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>