44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2772 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  100 
 
 
94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  60.44 
 
 
94 aa  123  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  49.38 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  48.45 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  58.73 
 
 
77 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.83 
 
 
373 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.83 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  51.06 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.83 
 
 
352 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  50.65 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  42.47 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  40.22 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  41.56 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  41.18 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  35.37 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.74 
 
 
346 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  38.57 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  42.11 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  38.27 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  43.1 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  38.27 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  38.27 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  38.03 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  32.22 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  36.07 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  39.06 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  32.86 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  41.38 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  33.8 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  44.64 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  46.94 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  34.62 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  39.29 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  40.38 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  31.88 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  42 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1797  hypothetical protein  35.21 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>