91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2406 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  100 
 
 
343 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  53.8 
 
 
337 aa  363  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  51.08 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  50.2 
 
 
253 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  44.49 
 
 
256 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  47.06 
 
 
253 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  41.21 
 
 
365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  48.21 
 
 
253 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  40.52 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  35.47 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  35.86 
 
 
360 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  36.21 
 
 
409 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  35.98 
 
 
416 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  35.94 
 
 
336 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  34.89 
 
 
342 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  35.4 
 
 
283 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  33.7 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  32.6 
 
 
342 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  32.85 
 
 
273 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  38.75 
 
 
311 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  34.17 
 
 
273 aa  136  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  31.58 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  33.33 
 
 
278 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  28.36 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  28.74 
 
 
326 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  32.85 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  33.21 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  36.22 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  28.74 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  34.42 
 
 
275 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  32.54 
 
 
328 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  31.23 
 
 
292 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  33.82 
 
 
288 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  29.43 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  32.11 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  37.5 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  31.82 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  32.49 
 
 
329 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  32.94 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  28.49 
 
 
315 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  33.6 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  33.01 
 
 
259 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  27.94 
 
 
305 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  30.13 
 
 
304 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  30.51 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  31.36 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  26.32 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  27.6 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  28.46 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  32.58 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  26.19 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  32.26 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  30.72 
 
 
543 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  26.17 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  28.22 
 
 
587 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.48 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
460 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  26.83 
 
 
458 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  39.22 
 
 
461 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  26.22 
 
 
454 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  39.22 
 
 
461 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  26.22 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  24.9 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.88 
 
 
458 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  25.61 
 
 
458 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  21.84 
 
 
577 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.42 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  37.25 
 
 
440 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  32.73 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  26 
 
 
389 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  32.35 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  25.44 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.77 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  32.84 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.72 
 
 
468 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  24.84 
 
 
459 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  28.7 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  33.33 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  28.7 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
189 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  29.09 
 
 
198 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1090  SAM (and some other nucleotide) binding protein  27.19 
 
 
197 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0379  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.93 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0479269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>