37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1812 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1812  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1172    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3362  hypothetical protein  59.76 
 
 		 574 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00117978  normal  0.0179726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3363  hypothetical protein  59.48 
 
 		 565 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000877827  hitchhiker  0.00789659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3367  hypothetical protein  58.12 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000828737  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3364  hypothetical protein  56.01 
 
 		 551 aa  591  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00271389  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.94 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  23 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.89 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  26.14 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  22.64 
 
 		 434 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  27.22 
 
 		 453 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  22.64 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.07 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  22.64 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.03 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  23.41 
 
 		 436 aa  50.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 446 aa  50.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.83 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  22.49 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  26.44 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 454 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.48 
 
 		 617 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  31.2 
 
 		 439 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 420 aa  45.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.76 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  21.46 
 
 		 888 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  24.77 
 
 		 437 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  21.32 
 
 		 646 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  27.97 
 
 		 348 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 444 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.64 
 
 		 415 aa  44.3  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  25 
 
 		 437 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.6 
 
 		 445 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>