43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0837 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0837  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  62.05 
 
 		 362 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  34.66 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  31.91 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.68 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.25 
 
 		 946 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0679  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.04 
 
 		 1095 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.34 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  26.18 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  29.1 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  29.1 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  26.24 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  32.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.14 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  34.69 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.68 
 
 		 1107 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.1 
 
 		 1110 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.79 
 
 		 1057 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.95 
 
 		 1064 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  30.25 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.86 
 
 		 1057 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.86 
 
 		 1057 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.57 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2664  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.02 
 
 		 1112 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.81 
 
 		 1067 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  31.73 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 		 1075 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  28.87 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  28.28 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.74 
 
 		 1074 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.77 
 
 		 1049 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.41 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.44 
 
 		 1071 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.21 
 
 		 939 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.42 
 
 		 1067 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.68 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.5 
 
 		 1086 aa  43.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.31 
 
 		 1067 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0438  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1110 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 307 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>