More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0574 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  100 
 
 		 364 aa  740    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  70.64 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  57.97 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  59.18 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  58.31 
 
 		 371 aa  434  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  57.26 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.3 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  57.26 
 
 		 369 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  56.6 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  57.26 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  55.74 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  54.62 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  50 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  49.15 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  49.72 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  47.93 
 
 		 365 aa  357  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  45.87 
 
 		 410 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  47.74 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  48.44 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  47.7 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  45.48 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  44.05 
 
 		 368 aa  315  9e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  46.7 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  48.02 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  43.09 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  44.81 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  45.26 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  43.24 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  43.29 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  42.93 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  29.22 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  26.78 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  26.67 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  26.74 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.37 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  26.52 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  27.55 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  24.1 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  24.79 
 
 		 330 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  24.79 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  21.92 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  24.79 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  25.33 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  25.55 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  32.75 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.89 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  42.71 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  41.18 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  34.51 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.5 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  33.81 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  37.82 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  32.18 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.9 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  37.4 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.46 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  37.37 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  39.17 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  36.97 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  33.57 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  31.25 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.35 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  34.85 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  35.61 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  41.38 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  28.32 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  28.32 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.27 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.19 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  41.86 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  43.53 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  40.21 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  36.13 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  30.61 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  34.09 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3612  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.08 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000132112  normal  0.101028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.38 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  31.9 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  32.12 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.81 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.48 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.63 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.87 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  38.1 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  32.32 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  38.37 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>