29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0268 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  30.6 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  25.68 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  24.13 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  24.02 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  24.64 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  31.39 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  31.39 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  22 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  24.34 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  22.4 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  22.59 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  23.7 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  25.84 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  32.69 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  31.21 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  23.28 
 
 		 2142 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  21.91 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  22.28 
 
 		 460 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  27.66 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  22.22 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  22.97 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  23.33 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  27.14 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  28.7 
 
 		 291 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  28.7 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  19.54 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  20.22 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  21.23 
 
 		 406 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>