38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1947 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  303  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  30.67 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  27.81 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  28.99 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  29.75 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  29.11 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.94 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  34.45 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  35.35 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  35.43 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  29.8 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  29.8 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  33.07 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  29.87 
 
 
218 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  31.5 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  29.75 
 
 
206 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  29.68 
 
 
218 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  36.51 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  34.92 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  32.26 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  31.75 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  34.86 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02346  hypothetical protein  35.11 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  31.67 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  33.04 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  35.4 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  33.64 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  29.7 
 
 
238 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  30.52 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  34.26 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  29.84 
 
 
540 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>