24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1324 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  31.4 
 
 
307 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  27.46 
 
 
298 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  28.38 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  25.16 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  26.92 
 
 
326 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  25 
 
 
326 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  26.75 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  29.77 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  25.86 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  32.1 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  28.79 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  28.79 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  30.86 
 
 
300 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.36 
 
 
487 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  27.35 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  30.43 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  30.49 
 
 
487 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  29.81 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.24 
 
 
386 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  27.74 
 
 
380 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  28.16 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  29.63 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  27.1 
 
 
376 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>