286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0897 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  100 
 
 
546 aa  1126    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  34.25 
 
 
560 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  34.22 
 
 
549 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  32.21 
 
 
551 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  32.46 
 
 
533 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  32.83 
 
 
533 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  33.15 
 
 
534 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  31.1 
 
 
535 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  30.91 
 
 
535 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  30.91 
 
 
535 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
535 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 
537 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  33.51 
 
 
403 aa  208  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  29.37 
 
 
535 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  27.07 
 
 
547 aa  190  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 
572 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  27.58 
 
 
549 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  26.51 
 
 
546 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  26.98 
 
 
538 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  31.53 
 
 
449 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  28.84 
 
 
416 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  25.35 
 
 
540 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  27.08 
 
 
421 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 
561 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  23.39 
 
 
561 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  22.41 
 
 
513 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  28.82 
 
 
553 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  29.82 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  29.44 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  29.27 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  27.93 
 
 
577 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  21.79 
 
 
539 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  24.34 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  23.29 
 
 
533 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.6 
 
 
129 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  33.6 
 
 
129 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  31.45 
 
 
129 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 
129 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  33.6 
 
 
129 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 
131 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
132 aa  64.3  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3704  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 
129 aa  63.9  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.600519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  29.03 
 
 
131 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 
129 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.08 
 
 
131 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  29.27 
 
 
148 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
132 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  29.27 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
123 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  22.08 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
127 aa  61.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  32.56 
 
 
132 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  30.08 
 
 
127 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
123 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
133 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
131 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
133 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
127 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
135 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 
129 aa  60.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
128 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
127 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  29.03 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  29.03 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
188 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
127 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  29.03 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  29.03 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  29.03 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
127 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
127 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  29.06 
 
 
127 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  29.84 
 
 
129 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  29.84 
 
 
129 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 
131 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  28.46 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>