105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0501 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  65.07 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  65.07 
 
 
271 aa  346  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  63.97 
 
 
271 aa  344  8e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.2 
 
 
831 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  23.68 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  31.73 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.32 
 
 
817 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.29 
 
 
938 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.9 
 
 
813 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  31.13 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  29.52 
 
 
121 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.83 
 
 
817 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  22.59 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  22.59 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  22.59 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  21.53 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  21.53 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  27.43 
 
 
120 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  20.78 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  29.81 
 
 
121 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  35.21 
 
 
75 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  42.03 
 
 
70 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  36.49 
 
 
81 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  35.62 
 
 
86 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  34.72 
 
 
78 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  34.67 
 
 
80 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  25.42 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  36.84 
 
 
82 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  32.5 
 
 
81 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  30.36 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  35.53 
 
 
82 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  32.88 
 
 
80 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.99 
 
 
864 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  38.67 
 
 
81 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  32.5 
 
 
82 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  37.1 
 
 
75 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  24.07 
 
 
127 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  37.68 
 
 
70 aa  45.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  37.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  36.36 
 
 
86 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  35.14 
 
 
99 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  38.67 
 
 
81 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  30 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  34.48 
 
 
114 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  38.78 
 
 
130 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  37.84 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  19.68 
 
 
834 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  32.89 
 
 
80 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  32.89 
 
 
80 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  31.58 
 
 
76 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  26.17 
 
 
120 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  34.48 
 
 
114 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  31.58 
 
 
86 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  28.43 
 
 
122 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  33.78 
 
 
81 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  34.72 
 
 
79 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  34.72 
 
 
79 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  33.72 
 
 
117 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
80 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  33.73 
 
 
114 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  35.38 
 
 
75 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  30.67 
 
 
83 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  38.36 
 
 
81 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  32.89 
 
 
78 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.05 
 
 
837 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  28.95 
 
 
76 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  28.95 
 
 
76 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  28.95 
 
 
76 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  28.95 
 
 
76 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>