35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2924 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  77.5 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  76.67 
 
 		 120 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  73.33 
 
 		 120 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  77.5 
 
 		 120 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  65.83 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  67.5 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  61.86 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  64.41 
 
 		 124 aa  147  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  64.41 
 
 		 124 aa  141  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  61.67 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  38.05 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  34.86 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  37.27 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  35.54 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  33.03 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  30.83 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  31.62 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  30.25 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  26.17 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  34.69 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  30.28 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  25.23 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  31.73 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  27.1 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  27.1 
 
 		 271 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  27.1 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  29.35 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  31.82 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  26.61 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  26.26 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  24 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  30.11 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  24.17 
 
 		 153 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>