30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1006 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  59.84 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  29.17 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  31.25 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  30.25 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  29.63 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  27.78 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  35.45 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  28.7 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  30.83 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  26.02 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  29.66 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  25.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  31.67 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  27.08 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  30.25 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  23.28 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  27.27 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  30.19 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  31.93 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  24.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3852  hypothetical protein  31.2 
 
 		 123 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000776129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  27.52 
 
 		 131 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  28.09 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  25.23 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  24.14 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0021  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  0.0439162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>