35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4889 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  35.59 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  34.45 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  29.91 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  35.59 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  30.08 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  35.54 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  36.61 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  36.28 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  36.36 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  34.71 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  34 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0021  hypothetical protein  37.23 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  0.0439162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  30.84 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  32.23 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  32.74 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  37.72 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  29.81 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  32.14 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  32.76 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  31.9 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  33.06 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  28.04 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  32.76 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  28.69 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  27.88 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  26.92 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  26.92 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  23.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  24.77 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>