13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2367 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  54.03 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0021  hypothetical protein  52.42 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  0.0439162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  30.84 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  31.91 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  32.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  29.41 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  28.43 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  32.53 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  28.4 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  29.17 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>