13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1186 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3313  hypothetical protein  30.25 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1277  hypothetical protein  25.76 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.112108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  25.71 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1175  hypothetical protein  39.13 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.268607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  20.33 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0021  hypothetical protein  43.08 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  0.0439162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  32.53 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  23.97 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  24.17 
 
 
122 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  22.22 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  41.54 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>