15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1002 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  57.23 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  67.77 
 
 
160 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  58.39 
 
 
160 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  62.5 
 
 
148 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  60.94 
 
 
150 aa  156  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  56.91 
 
 
178 aa  148  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  43.23 
 
 
148 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  37.7 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  40.8 
 
 
144 aa  94  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  40.87 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  29.66 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  26.79 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  22.22 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>