13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2148 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  283  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  44.37 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  46.03 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  47.2 
 
 
150 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  40.8 
 
 
154 aa  94  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  42.4 
 
 
160 aa  90.1  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  43.48 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  43.1 
 
 
160 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  38.84 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  32.04 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>