14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00099 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  297  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  43.23 
 
 
154 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  46.61 
 
 
148 aa  116  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  48.74 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  49.57 
 
 
160 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  44.37 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  43.2 
 
 
160 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  39.5 
 
 
178 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  33.56 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  27.97 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  26.12 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>